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Genetic algorithm for haplotyping and block partitioning

Name: Genetic algorithm for haplotyping and block partitioning
Brand: VDM Verlag
SKU: 06831469
Price: 62.29 EUR
Availability: InStock
Author: Nadezhda Sazonova
ISBN: 9783639237849

Nadezhda Sazonova

Sprache

Englisch

Buch Broschur

Libristo-Code: 06831469

Verlag VDM Verlag, März 2010

A new algorithm for performing simultaneous haplotype resolution and block partitioning is proposed.... Vollständige Beschreibung

Libristo-Code: 06831469

152 b

62.29 € inkl. MwSt.

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A new algorithm for performing simultaneous haplotype resolution and block partitioning is proposed. The algorithm is based on genetic algorithm approach and the parsimonious principle. The multiloculs LD measure (Normalized Entropy Difference) is used as a block identification criterion. The proposed algorithm incorporates missing data is a part of the model and allows blocks of arbitrary length. In addition, the algorithm provides scores for the block boundaries which represent measures of strength of the boundaries at specific positions. The results show that the proposed genetic algorithm provides the accuracy of haplotype decomposition within the range of the same indicators shown by the other algorithms. The proposed algorithm is also used in a new population clustering algorithm, which extracts from the given genotype sample two clusters with substantially different block structures and finds haplotype resolution and block partitioning for each cluster.

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Informationen zum Buch

Vollständiger Name Genetic algorithm for haplotyping and block partitioning

Autor Nadezhda Sazonova

Sprache

Englisch

Einband Buch - Broschur

Datum der Veröffentlichung 2010

Anzahl der Seiten 132

EAN 9783639237849

ISBN 3639237846

Libristo-Code 06831469

Verlag VDM Verlag

Gewicht 204

Abmessungen 152 x 229 x 8

Kategorie

Mathematik und Naturwissenschaften > Biologie, Biowissenschaften > Biowissenschaften, allgemein > Genetik (nicht-medizinisch)

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